Diskussion:DNA-Sequenzierung

Links & Bilder

Ich habe das Gefühl, dass seit der Sichtung kein Link zu anderen Artikeln und kein Bild mehr funktioniert! (nicht signierter Beitrag von 85.178.238.141 (Diskussion) 13. Juni 2008)

Reihenfolge bei "Sangermethode"

kann es sein dass hier etwas durcheinandergekommen ist?

Zitat:"Ausgehend von einem kurzen Abschnitt bekannter Sequenz (Primer) wird durch das Enzym DNA-Polymerase einer der beiden komplementären DNA-Stränge verlängert. Zunächst wird die DNA-Doppelhelix durch Erwärmung denaturiert, woraufhin Einzelstränge für das weitere Vorgehen zur Verfügung stehen."

...oder wird hier 2 mal denaturiert?

LG Hans --80.109.197.124 17:03, 19. Jun. 2007 (CEST)

Ich verstehe es so, dass in diesem Schritt 1x denaturiert werden muss, um eben die beiden komplementären Einzelstränge zur (danach erfolgenden) Verlängerung zu erhalten. Da es sich allerdings um eine Form der PCR handelt, wird mit jedem Zyklus auch eine neue Denaturierung erfolgen (müssen).

Grüße, Simon

Der Textteil mit dem folgenden Wortlaut: "Entweder der Primer oder die ddNTPs sind radioaktiv markiert. Nach der Sequenzier-Reaktion werden die markierten Abbruchprodukte aus jedem Ansatz mittels Polyacrylamid-Gelelektrophorese der Länge nach aufgetrennt. Durch Vergleich der vier Ansätze kann man die Sequenz nach der Entwicklung des radioaktiven Gels auf einem fotografischen Film ablesen. Die dementsprechend komplementäre Sequenz ist die Sequenz der verwendeten einsträngigen DNA-Matrize. Als Sequenzier-Reaktion kommt heutzutage eine Variation der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) zum Einsatz. Anders als bei der PCR wird nur ein Primer eingesetzt, sodass die DNA nur linear amplifiziert wird." ist für Laien (und an dei muss sich eine Enzyklopädie) schwer verständlich, weil er nicht leichtfasslich Vorstellungen von dem vermittelt, was praktisch getan wird. Ich meine, er sollte deshalb nochmals überarbeitet werden. Zum Beispielmüßte erwähnt werden, daß die Bruchstücke nach Größe/Länge aufgetrennt werden und daher das Bild von vier Leiterstrukturen entsteht. Da aufgrund der Markierung jede Leiter nur eines der vier möglichen End-Nucleotide der Bruchstücke darstellt, kann der Experimentator von einer zur anderen Leiter springend ablesen, in welcher Reihenfolge die Nucleotide in der ursprünglichen DNS nacheinander angeordnet waren.--Micha o.j. edob 22:22, 8. Jan. 2010 (CET)

Elektrophorese Sangermethode

Hallo,

ist es korrekt, dass zur Trennung der PCR-Produkte eine Polyacrylamid-Elektrophorese (PAGE) gemacht wird? Zur Trennung von Nukleinsäuren verwendet man doch normalerweise ein Agarosegel!?

Danke & Grüße, Simon

Die Verwendung der PAGE zur Auftrennung der Produkte nach der Sequenzierreaktion ist schon richtig, da Agarosegele hier nicht die nötige Auflösung (Unterschied von einer Base) bringen würden. Gruß, --Hoffmeier 14:49, 9. Okt. 2007 (CEST)

Toter Weblink

Bei mehreren automatisierten Botläufen wurde der folgende Weblink als nicht verfügbar erkannt. Bitte überprüfe, ob der Link tatsächlich unerreichbar ist, und korrigiere oder entferne ihn in diesem Fall!

• http://www.454.com/index2.html (archive)
  • In DNA-Sequenzierung on 2007-10-29 10:56:15, 404 Not Found
  • In DNA-Sequenzierung on 2007-10-29 14:06:01, 404 Not Found
  • In DNA-Sequenzierung on 2007-11-17 18:27:49, 404 Not Found

Die Webseite wurde vom Internet Archive gespeichert. Bitte verlinke gegebenenfalls eine geeignete archivierte Version: [1]. --KuhloBot 19:28, 17. Nov. 2007 (CET) Ich habe den toten Link gelöscht und durch den neuen ersetzt

pyrosequenzierung

wie isn das bei der methode und dem namen? kenn die auch noch unter 454 wegen den leuten die die entwickelt haben, siehe http://www.454.com/ vielleicht sollte man den verweis noch einbauen, bin mir aber mit der allgemeingültigkeit der bezeichnung nicht so ganz sicher. -- kOchstudiO Diskussion 22:13, 26. Jan. 2009 (CET)

Was da beschrieben ist, eigentlich wie Roche 454 funktioniert. Das ist sozusagen ein System, bei dem man Pyrosequenzierung in großen Mengen und parallel durchführen kann. Mir fehlen z.B. die Funktion von Sulfurylase und Apyrase, die für den ursprünglichen Mechanismus essentiell sind. (nicht signierter Beitrag von 95.91.235.164 (Diskussion) 17:18, 23. Feb. 2015 (CET))

Die Pyrosequenzierung ist so nicht richtig siehe https://www.youtube.com/watch?v=YQQRV5GYTV8--Dnvuma (Diskussion) 17:40, 19. Nov. 2020 (CET)

Grafik: Prinzip der DNA-Sequenzierung

Hallo, in der Grafik scheint ein kleiner Fehler zu sein. Dort, wo sich die Pfeile auffächern, sollte doch "Polymerase + dNTPs" statt "Polymerase + ddCTPs" stehen. Vielleicht kann das jemand korrigieren. Danke. -- Spurenimschnee 16:55, 13. Sep. 2009 (CEST)

Hab ich versucht, das Bild ist schon fertig, aber das Hochladen ist ja offenbar eine Wissenschaft für sich >:|, nix für Zwischendurch. -- Dr. Norman Mauder 17:18, 21. Sep. 2009 (CEST)

Name

Da dies hier die DEUTSCHSPRACHIGE wikipedia ist, sollte doch bitte auch die DEUTSCHSPRACHIGE Abkürzung verwendet werden, d.h. DNS-Sequenzierung! 94.220.248.158 08:40, 13. Feb. 2010 (CET)

Die häufigste Verwendung in der deutschen Sprache ist tatsächlich DNA. Damit gehört DNA bereits zur deutschen Sprache und daher braucht das Lemma auch nicht geändert zu werden. -- Ayacop 08:37, 5. Jun. 2010 (CEST)

Problemstellung

Die DNA-Sequenzierung als Ablesen der Nukleotidfolge der DNA war über Jahrzehnte hinweg bis in die Mitte der siebziger Jahre ein ungelöstes Problem. Heute stehen verschiedene biochemische bzw. biotechnologische Methoden zur Verfügung, weitere Details dazu im Abschnitt Sequenzierungsmethoden. Etwas holprige Formulierung oder? Vllt. sollte man einfach mal ein paar Probleme benennen, die bis dahin auftraten. Auch der Verweis auf einen Abschnitt der zwei Sätze später schon groß entgegenprankt scheint mir überflüssig. (nicht signierter Beitrag von 93.223.207.21 (Diskussion) 21:57, 26. Aug. 2010 (CEST))

Sequenzierung durch Hybridisierung

Zu diesem Zweck werden auf einem Glasträger (DNA-Chip oder Microarray) kurze DNA-Abschnitte (Oligonukleotide) in Matrix-Anordnung fixiert. Was ist eine Matrix-Anordnung? (nicht signierter Beitrag von 77.11.31.160 (Diskussion) 23:25, 18. Sep. 2010 (CEST))

so besser? -- Ayacop 07:26, 19. Sep. 2010 (CEST)

RNA Sequenzierung

RNA Sequenzierung wird ja immer wichtiger (Stichwort: RNA-Seq). Klar wird dabei erst in cDNA umgeschrieben, ich würde trotzdem vorschlagen das Lemma allgemeiner zu fassen etwa "Sequenzierung (DNA/RNA)" o.ä. und entsprechende Punkte im Artikel zu ergänzen. Was haltet ihr davon? --Allegretto 17:50, 30. Okt. 2010 (CEST)

PCR vor Sanger-DNA-Sequenzierung?

Hallo! Soweit ich weiß, muss vor der Sequenzierung der DNA das zu sequenzierende Gen zunächst mehrfach repliziert werden, oder? --217.232.86.23 (19:18, 11. Mai 2011 (CEST), Datum/Uhrzeit nachträglich eingefügt, siehe Hilfe:Signatur)

Sanger-Methode; Nucleosid oder Nucleotid?!

Bei Nucleosiden handelt es sich ja um Moleküle die aus einer Base und einem Zucker (Pentose) bestehen, allerdings keinen Phosphatrest tragen. Die in diesem Artikel beschriebenen Didesoxyribonukleosid-Triphosphate tragen aber einen Phosphatrest. Müsste es dann nicht logischerweise Didesoxyribonukleotid-Triphosphat heißen? Schließlich sind es die Nucleotide, welche Phosphatreste tragen. Oder aber es heißt Didesoxyribonukleosid-Triphosphate, da es ein Nucleosid mit Phosphatresten ist und wird als ganzes dann als Nucleotid bezeichnet. (nicht signierter Beitrag von 46.223.4.72 (Diskussion) 17:39, 3. Jan. 2013 (CET))

Du hast die Antwort schon selbst gegeben: "es heißt Didesoxyribonukleosid-Triphosphate, da es ein Nucleosid mit Phosphatresten ist und wird als ganzes dann als Nucleotid bezeichnet." und damit ist es auch im Artikel korrekt. --Nescius (Diskussion) 14:40, 3. Mär. 2013 (CET)

Dieser Abschnitt kann archiviert werden. biggerj1 (Diskussion) 18:16, 6. Apr. 2016 (CEST)

Wo ordnet sich die Plasma-Sequenzierung bei der DNA-Sequenzierung ein?

-- 256 -θ- 19:17, 16. Jul. 2015 (CEST)

Daten aktualisieren

Wenn in der Einleitung "1000 Genome (Stand 2010)" steht... Da gibt es doch heute bestimmt extrem viel mehr oder nicht? (nicht signierter Beitrag von 2003:DE:1BD3:9D00:577:687C:5C97:A447 (Diskussion) 11. Feb. 2018)