Geoarchaeota
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||
| Geoarchaeota | ||||||||||
| Kozubal et al. 2013 |
„Geoarchaeota“ (alias „Gearchaeota“, veraltet „Novel archaeal group I“, NAG1) ist ein vorgeschlagenes Kandidatenphylum der Archaeen. Zwar war es bisher nicht möglich, einzelne Vertreter zu kultivieren. Das bisherige Wissen stammt daher aus der Metagenomik. Diese Analysen ergaben, dass sie sich die Vertreter dieser Gruppe von anderen Archaeen signifikant unterscheiden. Gefunden wurden diese Genome in den heißen Quellen vom Yellowstone National Park. Sie sind daher thermophile Organismen, die (acidophil) in saurem Milieu leben und Eisen (Fe3+) reduzieren (Eisenreduzierer). Genetische Analysen ergaben, dass diese Organismen über Stoffwechselwege verfügen, die für den Katabolismus von Peptiden und komplexen Kohlenhydraten notwendig sind, sowie über einen bakteriellen Typ-I-Kohlenmonoxid-Dehydrogenase-Komplex.[1]
Das Phylum „Geoarchaeota“ ist vorschlagsgemäß ein Teil des „TACK-Superphylums“, zu dem es erst später hinzukam, so dass der Anfangsbuchstabe ‚G‘ nicht in die Abkürzung (‚TACK‘) einging.
Alternativ wurde vorgeschlagen, dass diese Organismen eher eine Linie der Ordnung Thermoproteales der Crenarchaeota (ebenfalls im „TACK-Superphylum“) als ein eigenes, neues Phylum darstellen,[2] oder eine eigene Ordnung „Geoarchaeales“ in dieser Umgebung.[3][4]
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Die Zuordnung der (vorgeschlagenen) Ordnung „Geoarchaeales“ zu einem Archaeen-Phylum wird noch diskutiert. Die folgende Systematik folgt im Wesentlichen dem National Center for Biotechnology Information (NCBI):[5]
- Phylum: „Geoarchaeota“ (alias „Gearchaeota“, veraltet en. Novel archaeal group I, NAG1)
- Ordnung: „Geoarchaeales“
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-C13
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-C20
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-E11
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-G12
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-L10
- Spezies Geoarchaeota archaeon JGI 000156CP-M09
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Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ Mark A Kozubal, Margaret Romine, Ryan deM Jennings, Zack J. Jay, Susannah G. Tringe, Doug B. Rusch, Jacob P. Beam, Lee Ann McCue, William P. Inskeep: Geoarchaeota: a new candidate phylum in the Archaea from high-temperature acidic iron mats in Yellowstone National Park, in: The ISME journal, Band 7, Nr. 3, S. 622–634, 15. November 2012, doi:10.1038/ismej.2012.132
- ↑ Lionel Guy, Anja Spang, Jimmy H. Saw, Thijs J. G. Ettema: 'Geoarchaeote NAG1' is a deeply rooting lineage of the archaeal order Thermoproteales rather than a new phylum, in: The ISME journal, Band 8, Nr. 7, S. 1353–1357, 13. Februar 2014, doi:10.1038/ismej.2014.6
- ↑ K Mendler, H Chen, D. H. Parks, L. A. Hug, A. C. Doxey: AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life. In: Nucleic Acids Research 47. 2019, S. 4442–4448, doi:10.1093/nar/gkz246 (uwaterloo.ca).
- ↑ GTDB release 05-RS95. In: Genome Taxonomy Database.
- ↑ NCBI: Candidatus Geoarchaeota (tree) und Geoarchaeota Kozubal et al. 2013 (phylum, alias NAG1, novel archaeal group I); graphisch: Candidatus Geoarchaeota, auf: Lifemap, NCBI Version.