SYBR Green I
| Strukturformel | |||||||||||||
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| Allgemeines | |||||||||||||
| Name | SYBR Green I | ||||||||||||
| Andere Namen |
2-{2-[(3-Dimethylamino-propyl)-propylamino]-1-phenyl-1H-chinolin-4-ylidenmethyl}-3-methyl-benzothiazol-3-ium-Kation | ||||||||||||
| Summenformel | C32H37N4S+ | ||||||||||||
| Externe Identifikatoren/Datenbanken | |||||||||||||
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| Eigenschaften | |||||||||||||
| Molare Masse | 509,27 g·mol−1 | ||||||||||||
| Aggregatzustand |
fest[1] | ||||||||||||
| Löslichkeit | |||||||||||||
| Sicherheitshinweise | |||||||||||||
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| Soweit möglich und gebräuchlich, werden SI-Einheiten verwendet. Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten bei Standardbedingungen (0 °C, 1000 hPa). | |||||||||||||
SYBR Green I (SG) ist ein asymmetrischer Cyanin-Farbstoff, der in der Molekularbiologie zum Nachweis von doppelsträngiger DNA benutzt wird.[3][4][5]
Eigenschaften
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SYBR Green I bindet doppelsträngige DNA. Der daraus resultierende DNA-Fluoreszenzfarbstoff-Komplex absorbiert blaues Licht bei einer Wellenlänge λmax = 494 nm und emittiert grünes Licht bei λmax = 521 nm. Weitere, wenn auch deutlich schwächere, Absorptionsmaxima liegen im UV-Bereich bei 284 nm und 382 nm. SYBR Green I bindet auch an Einzelstrang-DNA sowie RNA. Dieses Fluoreszenzsignal ist aber deutlich geringer, als wenn der Farbstoff an einer doppelsträngigen DNA gebunden ist. SYBR Green I ist mutagen und möglicherweise karzinogen.[2]
Verwendung
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]SYBR Green I wird zur Detektion von doppelsträngiger DNA verwendet, z. B. in der Gelelektrophorese, der Real time quantitative PCR und in Zellviabilitätstests. Alternativ wird Ethidiumbromid, Methylenblau oder die Silberfärbung zur Färbung von DNA verwendet. Höhere Konzentrationen an SYBR Green werden dafür verwendet, um Agarosegele zu färben, um dadurch DNA sichtbar zu machen. Ähnliche Cyanin-Farbstoffe zur Färbung von DNA sind z. B. SYBR Green II (zum Nachweis von RNA und einzelsträngiger DNA), SYBR Gold, SYBR Safe, YO (Oxazole Yellow), TO (Thiazole Orange) und PG (PicoGreen).
Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ CAS 163795-75-3 SYBR Green I. BOC Sciences; abgerufen am 14. Januar 2022
- ↑ a b c d Datenblatt SYBR Green I bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 15. Juni 2011 (PDF).
- ↑ Patent US5436134A: Cyclic-substituted unsymmetrical cyanine dyes. Angemeldet am 12. Juli 1993, veröffentlicht am 25. Juli 1995, Anmelder: Molecular Probes Inc, Erfinder: Richard P. Haugland et al.
- ↑ Patent US5658751A: Substituted unsymmetrical cyanine dyes with selected permeability. Angemeldet am 27. Oktober 1994, veröffentlicht am 19. August 1997, Anmelder: Molecular Probes Inc, Erfinder: Stephen T. Yue et al.
- ↑ H. Zipper et al.: Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications. In: Nucleic Acids Res., 2004, 32(12), S. e103; PMID 15249599, PMC 484200 (freier Volltext).