Thermodesulfobacteria
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Thermodesulfobacterium hydrogeniphilum | ||||||||||
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| Hatchikian et al. 2002 | ||||||||||
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| Thermodesulfobacteriales | ||||||||||
| Hatchikian et al. 2002 |
Die Thermodesulfobacteria sind eine Klasse anaerober, thermophiler und gramnegativer Bakterien. Innerhalb dieser Klasse gibt es eine einzige Ordnung, Thermodesulfobacteriales.[1][2][3][4] Typusgattung ist Thermodesulfobacterium in der Familie Thermodesulfobacteriaceae.[1]
Die Klasse Thermodesulfobacteria ist Mitglied des Phylums Thermodesulfobacteriota[1][2][5] alias Desulfobacterota,[2][3] für das 2001 bis 2021 ebenfalls die Bezeichnung Thermodesulfobacteria (Garrity & Holt 2021) sensu lato gebräuchlich war.[6][7][8]
Die Bakterienzellen der Thermodesulfobacteria sind in der Regel bacillusförmig (stäbchenförmige „Bazillen“).
Systematik
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Es gibt einzige Ordnung der Klasse Thermodesulfobacteria, nämlich Thermodesulfobacteriales. Bezüglich der Aufteilung dieser Ordnung in Familien besteht aber noch keine Einigkeit. Eine Konsens-Taxonomie der Klasse[5][4] benutzt folgende Quellen (Stand 28. Dezember 2023):
- L – LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature)[1]
- N – NCBI (National Center for Biotechnology Information)[2]
- G – GTDB (Genome Taxonomy Database)[3]
Synonyme und abweichende Schreibweisen sind in eckigen Klammern angegeben:
Phylum Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021(N)
[„Thermodesulfobacteraeota“ Oren et al. 2015,(N) Desulfobacterota Waite et al. 2023(N)]
- Klasse Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
[„Thermodesulfobacteriia“ Cavalier-Smith 2020,(L) Thermodesulfobacterium group]- Ordnung Thermodesulfobacteriales Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
- Familie Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian et al. 2002(L,N)
[Thermodesulfatatoraceae Waite et al. 2020(L)]- Gattung Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009(L,N)
- Spezies Caldimicrobium rimae Miroshnichenko et al. 2009(L,N) (Typus)(L)
- Spezies Caldimicrobium thiodismutans Kojima et al. 2016(L,N)
- Spezies „Caldimicrobium sp002441555“(G)
[„Thermodesulfobacteriaceae bacterium UBA6232“(N)]
– in der NCBI-Taxonomie zu Thermodesulfobacteriaceae ohne Gattungszuordnung- Referenzstamm: UBA6232(N,G)
- Gattung „Geothermobacterium“ Kashefi et al. 2002(L,N)
- Spezies „Geothermobacterium ferrireducens“ Kashefi et al. 2002(L,N) (Typus)(L)
- Gattung Thermodesulfobacterium Zeikus et al. 1995(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium commune Zeikus et al. 1995(L,N) (Typus)(L)
- Spezies „Thermodesulfobacterium geofontis“ Hamilton-Brehm et al. 2013(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium hveragerdense Sonne-Hansen & Ahring 2000(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium hydrogeniphilum Jeanthon et al. 2002(L,N)
- Spezies „Candidatus Thermodesulfobacterium syntrophicum“ Zehnle et al. 2023(L,N)
- Spezies Thermodesulfobacterium thermophilum (Rozanova & Khudyakova 1974) Rozanova & Pivovarova 1995(L,N)
Thermodesulfobacterium mobile (Rozanova & Khudyakova 1974) Rozanova & Pivovarova 1991,(L,N)
Desulfovibrio thermophilus Rozanova & Khudyakova 1974(L,N)]
- Gattung Thermosulfurimonas Slobodkin et al. 2012(L,N)
- Spezies Thermosulfurimonas dismutans Slobodkin et al. 2012(L,N) (Typus)(L)
- Spezies Thermosulfurimonas marina Frolova et al. 2019(L,N)
- Gattung Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009(L,N)
- Familie „ST65“(G) – provisorische Bezeichnung
– in der NCBI-Taxonomie zu Thermodesulfobacteriaceae- Gattung Thermosulfuriphilus Slobodkina et al. 2017(L,N,G)
– in der LPSN zu Thermodesulfobacteriota ohne Familien-Zuweisung- Spezies Thermosulfuriphilus ammonigenes Slobodkina et al. 2017 (Typus)(L,N,G)
- Referenzstamm: DSM 102941 alias ST65 oder VKM B-2855;(L,N,G)[A. 1]
- Referenzstamm: DSM 102941 alias ST65 oder VKM B-2855;(L,N,G)[A. 1]
- Spezies Thermosulfuriphilus ammonigenes Slobodkina et al. 2017 (Typus)(L,N,G)
- Gattung Thermosulfuriphilus Slobodkina et al. 2017(L,N,G)
- Familie Thermodesulfatatoraceae Waite et al. 2020(L,N,G)
– in der LPSN ein Synonym von Thermodesulfobacteriaceae- Gattung Thermodesulfatator Moussard et al. 2004(L,N,G)
- Spezies Thermodesulfatator atlanticus Alain et al. 2010(L,N,G)
- Referenzstamm: DSM 21156(L,N,G) alias AT1325 oder JCM 15391(L)
- Spezies Thermodesulfatator autotrophicus Lai et al. 2016(L,N,G)
- Spezies Thermodesulfatator indicus Moussard et al. 2004(L,N,G) (Typus)(L)
- Spezies Thermodesulfatator atlanticus Alain et al. 2010(L,N,G)
- Gattung Thermodesulfatator_A(G) – provisorische Bezeichnung
- Spezies „Thermodesulfatator_A atlanticus_A“(G) – provisorische Bezeichnung
- Referenzstamm: HyVt-533(G)
- Spezies …(G)
- Spezies „Thermodesulfatator_A atlanticus_A“(G) – provisorische Bezeichnung
- Gattung „JAADCO01“(G) – provisorische Bezeichnung
- Spezies „JAADCO01 sp013154385“(G) – provisorische Bezeichnung
– in der NCBI-Taxonomie nicht näher klassifiziert zu Thermodesulfobacteriota- Referenzstamm L_MaxBin.001(N,G) [Thermodesulfobacteriota bacterium isolate L_MaxBin.001[10]]
- Spezies „JAADCO01 sp013154385“(G) – provisorische Bezeichnung
- ohne Gattungszuweisung
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPB45“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPS7“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPT4“(N)
- Spezies „Unidentified Thermodesulfobacterium group OPT53“(N)
- Gattung Thermodesulfatator Moussard et al. 2004(L,N,G)
- ohne Familienzuweisung
- ohne Gattungszuweisung
- Spezies „Thermodesulfobacteriales bacterium T2R3“(N)
- ohne Gattungszuweisung
- Familie Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian et al. 2002(L,N)
- Ordnung Thermodesulfobacteriales Hatchikian et al. 2002(N,L,G)
Phylogenie
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Das folgende Kladogramm stellt basiert auf der 16S rRNA nach dem All-Species Living Tree Project (LTP), Stand LTP 106.[11]
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Anmerkungen
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]Einzelnachweise
[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]- ↑ a b c d LPSN: Class Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002.
- ↑ a b c d NCBI Taxonomy Browser: Thermodesulfobacteria, Details: Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002, equivalent: Thermodesulfobacterium group.
- ↑ a b c GTDB: Thermodesulfobacteria (class).
- ↑ a b Charles Thomas Parker: Thermodesulfobacteria Hatchikian et al. 2002 non Thermodesulfobacteria Garrity and Holt 2021, NamesforLife, LLC. 18. August 2022; doi:10.1601/nm.492, Taxon: doi:10.1601/tx.492 (englisch).
- ↑ a b Charles Thomas Parker: Thermodesulfobacteriota corrig. Garrity and Holt 2021, NamesforLife, LLC. 18. August 2022; doi:10.1601/nm.31634, Taxon: doi:10.1601/tx.491 (englisch).
- ↑ George M. Garrity, John G. Holt, E. Claude Hatchikian, Bernard Ollivier, Jean-Louis Garcia: Phylum BIII. Thermodesulfobacteria phy. nov. In: D. R. Boone, R. W. Castenholz (Hrsg.): Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, Band 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria, 2. Auflage, Springer-Verlag, New York 2001, Print ISBN 978-1-4419-3159-7, S. 389–393; Online ISBN 978-0-387-21609-6, doi:10.1007/978-0-387-21609-6_20 (englisch).
- ↑ Aharon Oren, George M. Garrity: Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 71, Nr. 10, 25. Oktober 2021, ISSN 1466-5034; doi:10.1099/ijsem.0.005056, PMID 34694987 (englisch).
- ↑ LPSN: Phylum "Thermodesulfobacteria" Garrity and Holt 2001.
- ↑ BacDive: Thermosulfuriphilus ammonigenes ST65. Auf: DSMZ.
- ↑ NCBI Nucleotide: MAG: Thermodesulfobacteriota bacterium isolate L_MaxBin.001, whole genome shotgun sequencing project, GenBank: JAADCO000000000.1.
- ↑ 'The All-Species Living Tree' Project (LTP): 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree) ( des vom 7. Mai 2012 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. (PDF). SILVA Comprehensive Ribosomal RNA Database (www.arb-silva.de).
