In der Saison 1999/2000 wurde zum letzten Mal in zwei Gruppen mit je acht Teams gespielt. Durch die neue Ligeneinteilung zur folgenden Saison 2000/01, in der die Anzahl der Teams in der 1. und der 2. Bundesliga von 32 auf 48 erhöht wurde, gab es in dieser Saison in der 2. Bundesliga keine Absteiger und 14 Aufsteiger. Zwei weitere Teams stiegen direkt von der Regionalliga in die 1. Bundesliga auf.
Ab der nächsten Saison wurde in vier Gruppen Nord, Ost, Süd und West mit je sechs Teams anstelle der bisherigen zwei Gruppen mit je acht Teams gespielt. Die neugebildeten Gruppen der 2. Bundesliga wurden regional sehr unterschiedlich mit Mannschaften aus der jeweiligen Regionalliga aufgefüllt. Im Norden und im Osten kamen alle sechs Teams der Gruppe aus der Regionalliga, im Süden und im Westen stiegen nur die Regionalliga-Meister auf. Aufsteiger waren:
