Allorhizobium

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Allorhizobium
Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Pseudomonadota
Klasse: Alphaproteobacteria
Ordnung: Hyphomicrobiales
Familie: Rhizobien (Rhizobiaceae)
Gattung: Allorhizobium
Wissenschaftlicher Name
Allorhizobium
de Lajudie et al. 1998[1][2]

Allorhizobium ist eine Gattung gramnegativer Bodenbakterien.[3][4] Einige Allorhizobium-Arten leben in einer stickstofffixierende Endosymbiose in den Wurzeln von Leguminosen, während von anderen bekannt ist, dass sie Kronengallen oder andere Pflanzenkrankheiten verursachen.

Systematik

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Nach der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) ist die Taxonomie der Gattung mit Stand 7. Januar 2024 wie folgt:[2]

Familie Rhizobiaceae Conn 1938

  • Gattung Allorhizobium de Lajudie et al. 1998[1]
    Gattung [Xaviernesmea Kuzmanović et al. 2022,
    Gattung „Affinirhizobium“ Ma et al. 2023]
    • Spezies Allorhizobium ampelinum Kuzmanović et al. 2022 [Allorhizobium vitis_A (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium borbori (Zhang et al. 2011) Mousavi et al. 2016[A. 1]
    • Spezies Allorhizobium oryzae (Peng et al. 2008) Mousavi et al. 2016 [Xaviernesmea oryzae (Peng et al. 2008) Kuzmanović et al. 2022, Pararhizobium oryzae (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium oryziradicis (Zhao et al. 2017) Lin et al. 2020 [„Allorhizobium oryziradicis“ (Zhao et al. 2017) Hoerdt et al. 2020, Rhizobium oryziradicis Zhao et al. 2017 (NCBI)]
    • Spezies Allorhizobium pseudoryzae (Zhang et al. 2011) Mousavi et al. 2016
    • Spezies Allorhizobium sonneratiae Li et al. 2023 [Allorhizobium sp023700755 (GTDB)]
    • Spezies Allorhizobium taibaishanense (Yao et al. 2012) Hördt et al. 2020 [„Allorhizobium taibaishanense“ (Yao et al. 2012) Mousavi et al. 2015]
    • Spezies Allorhizobium terrae Lin et al. 2020
    • Spezies Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 (Typus)[1]
    • Spezies Allorhizobium vitis (Ophel & Kerr 1990) Mousavi et al. 2016 [„Allorhizobium vitis“ Brenner et al. 2005]
Mögliche weitere Mitglieder der Gattung nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI):[5]
  • Spezies Allorhizobium sp. 7A-195
  • Spezies Allorhizobium sp. Av2
  • Spezies Allorhizobium sp. CTOTU49807
  • Spezies Allorhizobium sp. CTOTU50464
Nach der Genome Taxonomy Database (GTDB) gehören folgende bisher anderen Gattungen zugeordnete Spezies zu Allorhizobium:[6]
  • Spezies Allorhizobium albertimagni [Agrobacterium albertimagni] (mit Stamm AOL15)
  • Spezies Allorhizobium cremeum [Rhizobium cremeum] (mit Stamm W16)
  • Spezies Allorhizobium daejeonense [Rhizobium daejeonense] (mit Stamm L61)
  • Spezies Allorhizobium desertarenae [Peteryoungia desertarenae] (mit Stamm ADMK78)
  • Spezies Allorhizobium ferrooxidans [Ciceribacter ferrooxidans] (mit Stamm F8825)
  • Spezies Allorhizobium glycinendophyticum [Rhizobium glycinendophyticum] (mit Stamm CL12)
  • Spezies Allorhizobium halophytocola [Rhizobium halophytocola] (mit Stamm DSM 21600)
  • Spezies Allorhizobium ipomoeae [Peteryoungia ipomoeae] (mit Stamm shin9-1)
  • Spezies Allorhizobium lividum [Ciceribacter lividus] (mit Stamm DSM 25528)
  • Spezies Allorhizobium naphthalenivorans [Ciceribacter naphthalenivorans] (mit Stamm NBRC 107585)
  • Spezies Allorhizobium naphthalenivorans_A [Ciceribacter naphthalenivorans] (mit Stämmen T2.26MG-112.21 und T2.30D-1.1)
  • Spezies Allorhizobium rhizophilum [Rhizobium rhizophilum] (mit Stamm 7209-2)
  • Spezies Allorhizobium rosettiformans [Rhizobium rosettiformans W3] (mit Stamm W3)
  • Spezies Allorhizobium selenitireducens [Ciceribacter selenitireducens ATCC BAA-1503] (mit Stamm ATCC BAA-1503)
  • Spezies Allorhizobium thiooxidans [Ciceribacter thiooxidans] (mit Stamm F43B)
  • Spezies Allorhizobium wuzhouense [Rhizobium wuzhouense] (mit Stamm W44)

Verschiebungen nach der LPSN:[2]

  • Spezies „Allorhizobium paknamense“ (Kittiwongwattana & Thawai 2013) Mousavi et al. 2015 → Rhizobium paknamense Kittiwongwattana & Thawai 2013

Die GTDB führt als Abspaltungen Allorhizobium vitis_A, B, D, E, F.[6]

Die Zuordnung vieler Spezies zur Gattung ist also noch umstritten. Weitgehende Einigkeit besteht aber bei der Typusart Allorhizobium undicola sowie Allorhizobium terrae und Allorhizobium vitis, mit Einschränkungen bei Allorhizobium sonneratiae [Allorhizobium sp023700755[6]] und Allorhizobium ampelinum [Allorhizobium vitis_A[6]].

Etymologie

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Der Gattungsname Allorhizobium ist abgeleitet von altgriechisch άλλος allos, deutsch ‚anders‘, ‚verschieden‘ und neulateinisch Rhizobium, einer verwandten, aber phylogenetisch anderen Bakteriengattung. Allorhizobium bedeutet daher eine von Rizobium verschiedene Bakteriengattung.[2]

Anmerkungen

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  1. ↑ GTDB: Rhizobium_B borbori [„Ectorhizobium borbori“ (Zhang et al. 2011) Ma et al. 2023]

Einzelnachweise

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  1. ↑ a b c Philippe de Lajudie, Etike Laurent-Fulele, Anne Willems, Urbain Torck, Renata Coopman, Matthew D. Collins, Karel Kersters, Bernard Dreyfus, Monique Gillis: Allorhizobium undicola gen. nov., sp. nov., nitrogen-fixing bacteria that efficiently nodulate Neptunia natans in Senegal. In: International Journal of Systematic Bacteriology, Band 48, Nr. 4, 1. Oktober 1998, S. 1277–1290, doi:10.1099/00207713-48-4-1277, PMID 9828428, ResearchGate: 282169308 (englisch).
  2. ↑ a b c d LPSN: Genus Allorhizobium de Lajudie et al. 1998.
  3. ↑ Seyed Abdollah Mousavi, Janina Österman, Niklas Wahlberg, Xavier Nesme, Céline Lavire, Ludovic Vial, Lars Paulin, Philippe de Lajudie, Kristina Lindström: Phylogeny of the Rhizobium–Allorhizobium–Agrobacterium clade supports the delineation of Neorhizobium gen. nov. In: Systematic and Applied Microbiology, Band 37, Nr. 3, Mai 2014, S. 208–215; doi:10.1016/j.syapm.2013.12.007, PMID 24581678 (englisch).
  4. ↑ Seyed Abdollah Mousavi, Anne Willems Xavier Nesme, Philippe de Lajudie, Kristina Lindström: Revised phylogeny of Rhizobiaceae: proposal of the delineation of Pararhizobium gen. nov., and 13 new species combinations. In: Systematic and Applied Microbiology, Band 38, Nr. 2, März 2015, S. 84–90, doi:10.1016/j.syapm.2014.12.003, PMID 25595870 (englisch).
  5. ↑ NCBI Taxonomy Browser: Allorhizobium, Details: Allorhizobium de Lajudie et al. 1998?
  6. ↑ a b c d GTDB: Allorhizobium (genus).
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