Pascal Pauli studierte Geschichte an der Universität Zürich. Von 2010 bis 2015 arbeitete er als wissenschaftlicher Mitarbeiter für die Stiftung Geschichte Kloster Muri. Zu seinen Aufgaben gehörten die Erschliessung des Stiftsarchivs Muri-Gries sowie das Einrichten einer Sammlung im Gebäude des ehemaligen Klosters Muri. Mit dieser Anstellung verbunden war das Verfassen einer Dissertation, die er 2017 im Chronos Verlag publizierte.
Seit 2015 arbeitet er als wissenschaftlicher Mitarbeiter beim Staatsarchiv des Kantons Zürich.