Closteroviridae

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Closteroviridae

Closteroviridae

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[2]
Reich: Orthornavirae[1]
Phylum: Kitrinoviricota[1]
Klasse: Alsuviricetes[1]
Ordnung: Martellivirales[1]
Familie: Closteroviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: helikal
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Closteroviridae
Links
ICTV Taxon History: 201902978
NCBI Taxonomy: 69973
ViralZone (Expasy, SIB): 34

Die Closteroviridae (nicht zu verwechseln mit den Klosneuviren, gefunden in Klosterneuburg) sind eine Familie von RNA-Viren, die Pflanzen infizieren.[3][4]

Aufbau

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Virion

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Die Virionen (Viruspartikel) der Closteroviridae besitzen ein helikal-filamentöses Kapsid (gewunden fadenförmig) mit einer variablen Länge von etwa 650 nm bis über 2200 nm und einem Durchmesser von 10–13 nm. Das virale Genom ist einzelsträngig mit positiver Polarität bei einer Länge von etwa 13 bis 19 Kilobasen, mit unterschiedlicher Segmentierung des Genoms. Das Genom ist in einem Kapsid verpackt, das aus dem Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) aufgebaut ist und beidseitig vom Nebenkapsidprotein (engl. minor capsid protein, mCP) gedeckelt wird.

Genom

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Voraussichtliche Sekun­där­struktur des 3'-Pseudo­kno­tens im Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus (SPCSV), Gattung Crini­virus
Genomstruktur exemplarischer Viren verschiedener Gattungen der Clostero­viri­dae
Genomkarte: Beet yellow virus (BYV) und Carrot yellow leaf virus (CYLV), beide Gattung Closterovirus

Das Genom der Closteroviridae gehört zu den größten RNA-Genomen von Pflanzenviren. Es enthält linear angeordnete Duplikate kodierender Sequenzen wie auch zum Teil nicht-virale Abschnitte (z. B. für Proteasen und das Hsp70), die durch RNA-Rekombination flexibel integriert werden können. Einige Spezies bilden subvirale, kleine Partikel, die nur Teile des Genoms oder subgenomische virale RNA enthalten. Das Genom des Beet yellows virus (BYT) kodiert für die Proteine ORF1a (enthält die RNA-Polymerase), ORF1ab (enthält ebenfalls die RNA-Polymerase), p6, MP/Hsp70h, p64, CPm, Cp, p20 und p21.

Systematik

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Innere Systematik

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Die Gattungen der Familie unterscheiden sich in der Segmentierung des Genoms und in der Art der Übertragung. Die Genome der Ampeloviren sind einteilig segmentiert aufgebaut und werden durch Schmierläuse und andere Schildläuse übertragen, während das Genom der Closteroviren einteilig ist und durch Blattläuse weitergegeben wird und das Genom der Criniviren zwei- oder dreiteilig ist und durch die weiße Fliege übertragen wird.[5] Die folgende Gliederung der Closteroviridae in Genera folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand Mitte April 2024:[6][7]

Familie Closteroviridae

  • Spezies Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV1, GLRaV-1)
  • Spezies Grapevine leafroll-associated virus 3 (ehem. Typus, GLRaV3, GLRaV-3)
  • Spezies Grapevine leafroll-associated virus 4 (GLRaV4, GLRaV-4)
  • Spezies Grapevine leafroll-associated virus 13 (GLRaV13, GLRaV-13)
  • Spezies Little cherry virus 2 (LChV-2)
  • Spezies Yam asymptomatic virus 1 (YaV1)
  • Spezies Blueberry virus A (BVA)
  • Spezies Arracacha virus 1 (ArrV-1)
  • Spezies Beet yellow stunt virus (BYSV)
  • Spezies Beet yellows virus (ehem. Typus, Beet-yellows-Virus, BYV, BETV)
  • Spezies Blackcurrant closterovirus 1 (BCCV-1)
  • Spezies Burdock yellows virus (BuYV)
  • Spezies Carnation necrotic fleck virus (CNFV)
  • Spezies Carrot closterorivus 1 (CtCV1)
  • Spezies Carrot yellow leaf virus (CYLV)
  • Spezies Citrus tristeza virus (CTV)
  • …
  • Spezies Lettuce infectious yellows virus (ehem. Typus, Lettuce-infectious-yellows-Virus, LIYV)
  • Spezies Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus (SPCSV)
  • …
  • Spezies Mint vein banding-associated virus (MVBaV)
  • Spezies Actinidia virus 1 (AcV1)
  • Spezies Olive leaf yellowing-associated virus (OLYaV)
  • Spezies Persimmon virus B (PeBV1)
  • Spezies Grapevine leafroll-associated virus 7 (ehem. Typus, GLRaV7, GLRaV-7)
  • Spezies Little cherry virus 1 (LChV-1)
  • …
  • Daneben gibt es noch etliche vorgeschlagene Spezies, die keinem Genus zugeordnet sind (Auswahl):[11]
  • Spezies „Alcea rosea virus 1“
  • Spezies „Arracacha latent virus C“
  • Spezies „Jujube closterovirus 1“
  • Spezies „Peony leafroll-associated virus“
  • Spezies „Ripohuk virus“
  • Spezies „Stellaria aquatica virus C“

Äußere Systematik

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Koonin et al haben 2015 die Closteroviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[12] Schwestergruppe ist danach die Familie Virgaviridae.[13] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020.[1] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.

Literatur

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  • G. P. Martelli et al.: Family Closteroviridae. In: A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012 S. 987ff, ISBN 978-0-12-384684-6
  • D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.
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Commons: Closteroviridae – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

Einzelnachweise

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  1. ↑ a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 (Memento des Originals vom 2. August 2022 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 (Memento des Originals vom 30. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org MSL #34, Feb. 2019
  3. ↑ R. Flores, P. Moreno, B. Falk, G. P. Martelli, W. O. Dawson: e-Book on Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 411, ISSN 1664-302X; doi:10.3389/fmicb.2013.00411, PMID 24409172, PMC 3873501 (freier Volltext) (englisch).
  4. ↑ G. P. Martelli, A. A. Agranovsky, M. Bar-Joseph, D. Boscia, T. Candresse, R. H. Coutts, V. V. Dolja, B. W. Falk, D. Gonsalves, W. Jelkmann, A. V. Karasev, A. Minafra, S. Namba, H. J. Vetten, G. C. Wisler, N. Yoshikawa: The family Closteroviridae revised. In: Archives of virology. Band 147, Nummer 10, Oktober 2002, S. 2039–2044, ISSN 0304-8608; doi:10.1007/s007050200048, PMID 12376765 (englisch).
  5. ↑ L. Rubio, J. Guerri, P. Moreno: Genetic variability and evolutionary dynamics of viruses of the family Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 151, ISSN 1664-302X. doi:10.3389/fmicb.2013.00151. PMID 23805130. PMC 3693128 (freier Volltext).
  6. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  7. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  8. ↑ SIB: Ampelovirus, auf: ViralZone
  9. ↑ SIB: Closterovirus, auf: ViralZone
  10. ↑ SIB: Crinivirus, auf: ViralZone
  11. ↑ NCBI Taxonomy Browser: unclassified Closteroviridae.
  12. ↑ Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  13. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Band 479–480, Mai 2015, S. 2–25; doi: 10.1016/j.virol.2015.02.039, PMID 25771806, PMC 5898234 (freier Volltext), Epub 12. März 2015 (englisch).
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