Zu einem Eklat kam es während der dritten Etappe. Der DeutscheMarcel Kittel von Quick-Step Floors, Führender in der Gesamtwertung zu diesem Zeitpunkt, wurde von dem UkrainerAndrij Hrywko vom Astana Pro Team mit dem Ellenbogen ins Gesicht geschlagen. Kittel musste behandeln sich lassen. Trotz diesen Schlags wurde Kittel beim Etappensieg John Degenkolb von Trek-Segafredo noch Elfter und behielt die Gesamtführung. Grivko wurde disqualifiziert und von diesem Rennen ausgeschlossen.[1][2] Das Astana-Team entschuldigte sich anschließend nach der Etappe bei Kittel während Grivko sich auch entschuldigte, aber Kittel auch mitschuldig, da Kittel ihn mehrmals auf einer Windkante von der Straße drängen wollte.[3] Kittel forderte für Grivko eine mehrmonatige Sperre für den Ukrainer und wollte zunächst keine Entschuldigung annehmen.[4] Die Disziplinarkommission der UCI suspendierte im April 2017 Grivko deshalb ab dem 1. Mai bis zum 14. Juni für 45 Tage.[5]
Die vierte Etappe von Dubai nach Hatta Dam über 172 km wurde zuerst aufgrund eines Sandsturms auf 109 km verkürzt. Dies bedeutete, dass nicht in Dubai gestartet wird, sondern es rund um Hatta zwei Runden zu 51,1 km geben sollte plus den Aufstieg Richtung Hatta Dam. Letztendlich wurde dieses Vorhaben verworfen kurz vor dem Start dieser Etappe. Die Etappe wurde komplett gestrichen auch wegen Fahrerprotesten.[6]