Er wurde als Widerstandsverdächtiger verhaftet und vermutlich 1942 über das Wehrmachtsgefängnis in Gent heimlich als Nacht-und-Nebel-Häftling ins Zuchthaus Hameln deportiert. Von der deutschen Justiz wurde er am 26. Juni 1943 an die Geheime Staatspolizei überstellt und dann in das KZ Natzweiler-Struthof verschleppt.[1] Edmond Vanwaes starb dort am 31. Mai 1944.