Die FIFA-Klub-Weltmeisterschaft 2006 (engl.: FIFA Club World Cup 2006) war die dritte Austragung dieses weltweiten Fußballwettbewerbs für Vereinsmannschaften und fand vom 10. bis 17. Dezember erneut in Japan statt.
Gegenüber dem Vorjahr gab es keine Änderungen am Austragungsmodus. Das Turnier wurde wieder mit den Siegern der sechs kontinentalen Meisterwettbewerbe auf Klubebene aus Asien, Afrika, der CONCACAF-Zone, Südamerika, Europa und Ozeanien im K.-o.-System ausgetragen. In acht Tagen fanden insgesamt sieben Spiele statt. Dabei waren die Teams aus Europa und Südamerika wieder für das Halbfinale gesetzt und bestritten nur je zwei Spiele. Die anderen vier Teams ermittelten in zwei Viertelfinalpartien die anderen beiden Teilnehmer für das Halbfinale.
Aufgrund des Wechsels des australischen Fußballverbands von der OFC zur AFC und der damit geringeren Spielstärke der OFC-Klubs wurde Anfang 2006 eine Regeländerung vorgeschlagen. Der Sieger des OFC Champions Cup sollte in einer Vorrunde gegen den japanischen Meister um einen Platz im Viertelfinale spielen. Diese Änderung wurde jedoch vom FIFA-Exekutiv-Ausschuss vorerst abgelehnt.
Der "Goldene Ball" für den besten Spieler des Turniers ging an den Portugiesen Deco vom FC Barcelona. Der "Silberne Ball" ging an den Brasilianer Pedro Iarley vom SC Internacional und der "Bronzene Ball" mit Ronaldinho von FC Barcelona an einen weiteren Brasilianer.