Die Gauliga Niederrhein 1942/43 war die zehnte Spielzeit der Gauliga Niederrhein im Fußball. Die Meisterschaft wurde in dieser Saison erneut im Rundenturnier mit zehn Mannschaften ausgetragen. Die Gaumeisterschaft sicherte sich zum ersten Mal Westende Hamborn mit einem Punkt Vorsprung vor TuS Helene Altenessen. Damit qualifizierte sich Hamborn für die deutsche Fußballmeisterschaft 1942/43, bei der die Mannschaft durch ein Freilos in der 1. Runde das Achtelfinale erreichten, dieses aber deutlich mit 1:8 gegen den VfR Mannheim verloren. Der SSV Wuppertal zog sich während der Saison vom Spielbetrieb zurück, alle bereits ausgetragenen Spiele wurden annulliert. Den weiteren Abstiegsrang belegte Schwarz-Weiß Essen. Aus den Bezirksligen stiegen Gelb-Weiß Hamborn und Fortuna Düsseldorf auf.
Der eigentliche Sieger der Gruppe, Duisburger SpV, bildete in der kommenden Spielzeit eine Kriegsspielgemeinschaft mit TuS Duisburg 48/99, welche den Gauliga-Startplatz von TuS Duisburg übernahm. Dadurch stieg der Zweitplatzierte in dieser Gruppe ebenfalls in die Gauliga auf.