Erste internationale Erfahrungen sammelte Habtom Samuel im Jahr 2021, als er bei den U20-Weltmeisterschaften in Nairobi in 7:52,69 min die Bronzemedaille im 3000-Meter-Lauf gewann und über 5000 Meter in 13:31,10 min den vierten Platz belegte. Im Jahr darauf startete er im 10.000-Meter-Lauf bei den Weltmeisterschaften in Eugene und gelangte dort mit 28:01,81 min auf den 17. Platz. Anschließend gewann er bei den U20-Weltmeisterschaften in Cali in 14:03,67 min die Bronzemedaille über 5000 Meter und belegte in 8:03,98 min den achten Platz über 3000 Meter.