Jalutorowsk wurde 1659 als Handelsposten Jalutorowski Ostrog, später Jalutorowskaja Sloboda am Ort einer alten tatarischen Siedlung namens Jawla-Tur gegründet. Eine erste, 1930 jedoch von den Kommunistengeschleifte, Steinkirche wurde 1777 erbaut, 1782 wurde der Siedlung das Stadtrecht verliehen.
Während des gesamten 19. Jahrhunderts war die Stadt ein Verbannungsort, sowohl Teilnehmer des Dekabristen-Aufstandes wie auch polnische Aufständische der Erhebungen von 1830/31 und 1863 wurden nach Jalutorowsk verbannt. Gerade die Dekabristen hatten großen Einfluss auf die kulturelle Entwicklung der Stadt und auch der ganzen Region um Tjumen; der Dekabrist Jakuschkin begründete 1841 die erste richtige Schule für Jungen im Ort, auf seine Initiative ging auch die spätere Gründung der ersten Mädchenschule zurück. Matwei Iwanowitsch Murawjow-Apostol, einzig überlebender Bruder des Dekrabristenführers Sergei Iwanowitsch Murawjow-Apostol, verbrachte die Verbannung ebenfalls in Jalutorowsk, sein Haus dient heute als eines der Gebäude des lokalen Museums.
↑ abItogi Vserossijskoj perepisi naselenija 2010 goda. Tom 1. Čislennostʹ i razmeščenie naselenija (Ergebnisse der allrussischen Volkszählung 2010. Band 1. Anzahl und Verteilung der Bevölkerung). Tabellen 5, S. 12–209; 11, S. 312–979 (Download von der Website des Föderalen Dienstes für staatliche Statistik der Russischen Föderation)