Die Moncton Wildcats wurden 1994 als Franchise der Québec Major Junior Hockey League gegründet. Nachdem sie in ihrer ersten Spielzeit noch als Moncton Alpines (in Anlehnung an ein ehemaliges AHL-Team) spielten, treten sie seit der Saison 1995/96 unter ihrem jetzigen Namen an. In der Saison 2003/04 zogen sie erstmals in das Finale um die Coupe du Président ein, unterlagen dort jedoch den Olympiques de Gatineau in der Best-of-Seven-Serie mit 1:4-Siegen. Zwei Jahre später erreichte die Mannschaft erneut das Finale der LHJMQ. Dieses Mal schlugen die Wildcats die Remparts de Québec mit 4:2-Siegen. Im anschließenden Finalturnier um den Memorial Cup wurden sie zunächst Zweiter der Gruppenphase, ehe sie im anschließenden Finale den Remparts, die sie noch im LHJMQ-Finale besiegten, mit 2:6 unterlagen. In der Saison 2008/09 schied Moncton in der zweiten Playoff-Runde gegen die Océanic de Rimouski aus. Eine Saison später wurde der zweite Coupe du Président der Franchisegeschichte gewonnen.