Okongwu stammt von nigerianischen Eltern ab,[2] er besuchte die Chino Hills High School in Kalifornien. Zweimal wurde er in dem US-Bundesstaat mit der Auszeichnung „Mr. Basketball“ versehen.[1] Im Mai 2018 gab er seinen Entschluss bekannt, ab der Saison 2019/20 an der University of Southern California spielen zu wollen.[3] Im Spieljahr 2019/20 war er in der USC-Hochschulmannschaft in den statistischen Werten Punkte pro Spiel (16,2), Rebounds pro Spiel (8,6) sowie Blocks pro Spiel (2,7) führend.[4]
Ende März 2020 gab er bekannt, ins Profilager zu wechseln und sich für das Draftverfahren der NBA im selben Jahr einzuschreiben.[5] Okongwu wurde in mehreren Vorschauranglisten als ein Kandidat auf einen der vorderen Plätze geführt,[6][7] teils auch unter den ersten Fünf.[8] Er wurde letztlich an sechster Stelle von den Atlanta Hawks aufgerufen.[9]