Quantitative immunoprecipitation combined with knock-down

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Quantitative immunoprecipitation combined with knock-down ist eine biochemische Methode zur Bestimmung von Protein-Protein-Interaktionen. Sie ist eine Kombination aus SILAC, RNA-Interferenz (RNAi), Co-Immunpräzipitation und quantitativer Massenspektrometrie.[1][2] Da diese Methode auf SILAC basiert und somit auf Auxotrophien für Arginin oder Lysin angewiesen ist, wurde eine Variante mit einer metabolischen Markierung mit 15N entwickelt.[3]

Einzelnachweise

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  1. ↑ M. Selbach, M. Mann: Protein interaction screening by quantitative immunoprecipitation combined with knockdown (QUICK). In: Nature methods. Band 3, Nummer 12, Dezember 2006, S. 981–983, doi:10.1038/nmeth972, PMID 17072306.
  2. ↑ P. Braun, M. E. Cusick, M. Vidal: QUICKstep and GS-TAP: new moves for protein-interaction analysis. In: Nature methods. Band 3, Nummer 12, Dezember 2006, S. 975–976, doi:10.1038/nmeth1206-975, PMID 17117154.
  3. ↑ S. Schmollinger, D. Strenkert, V. Offeddu, A. Nordhues, F. Sommer, M. Schroda: A protocol for the identification of protein-protein interactions based on 15N metabolic labeling, immunoprecipitation, quantitative mass spectrometry and affinity modulation. In: Journal of visualized experiments : JoVE. Nummer 67, September 2012, S. , doi:10.3791/4083, PMID 23051728, PMC 3490270 (freier Volltext).
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