Bei einem unentschiedenen Spielstand nach regulären 90 Minuten kommt es, wie in anderen Pokalwettbewerben, zu einer zweimal 15 minütigen Verlängerung und, falls immer noch kein Sieger feststeht, im Anschluss zu einem Elfmeterschießen.
Alle schleswig-holsteinischen Mannschaften, die in der Vorsaison oberhalb der Oberliga Schleswig-Holstein spielten, waren automatisch qualifiziert. Ausgenommen war der Zweitligist Holstein Kiel, da die Vereine der Bundesliga und 2. Bundesliga nicht an den Verbandspokalen teilnehmen und automatisch für den DFB-Pokal qualifiziert sind. Zudem qualifizierten sich die Kreispokalsieger und ein Finalist der 11 Kreisfußballverbände. Zweitmannschaften waren nicht teilnahmeberechtigt.
Folgende Mannschaften waren somit für den SHFV-Pokal 2021/22 qualifiziert (in der Klammer ist die Ligenzugehörigkeit in dieser Spielzeit angegeben):