In der Saison 2008/09 der Schweizer Bundesliga im Schach lieferten sich der ASK Winterthur, Valais und der Titelverteidiger Schachverein Birsfelden/Beider Basel einen Dreikampf um den Titel. Winterthur setzte sich an die Spitze, und da sowohl Valais als auch Birsfelden/Beider Basel wegen Aufstellungsfehlern je 2 Mannschaftspunkte abgezogen wurden[1], fiel der Vorsprung mit zwei Mannschaftspunkten auf Valais und drei Mannschaftspunkten auf Birsfelden/Beider Basel am Ende deutlich aus.
Aus der 2. Bundesliga war der Schachclub Niederrohrdorf aufgestiegen und erreichte den Klassenerhalt. Rein sportlich wäre Lugano CS als Tabellenletzter abgestiegen, da jedoch Birsfelden/Beider Basel seine Mannschaft zurückzog, erreichte Lugano noch den Klassenerhalt[1]
Zu den gemeldeten Mannschaftskadern der teilnehmenden Vereine siehe Mannschaftskader der schweizerischen 1. Bundesliga im Schach 2008/09.
Das Aufstiegsspiel zwischen den beiden Siegern der Zweitligastaffeln, dem SC Kirchberg und dem Schachklub Réti Zürich fand am 6. Juni in Kirchberg statt.[1] Réti Zürich gewann mit 6½:1½ und stieg damit in die 1. Bundesliga auf.[2]