Sebastian Deindl

Sebastian Deindl (* 16. März 1978 in Basel) ist ein deutsch-schwedischer Biochemiker, Molekularbiophysiker und Strukturbiologe.

Leben

Sebastian Deindl studierte Biochemie an der Universität Tübingen und lernte dabei die Strukturbiologie intensiv kennen. Er schloss sein Studium 2004 mit dem Diplom ab. 2009 promovierte er an der University of California, Berkeley, unter der Betreuung von John Kuriyan. Während dieser Zeit konzentrierte sich seine Forschung auf die biophysikalischen Mechanismen der Signalübertragung und die Struktur von Proteinkomplexen.

Nach seiner Promotion war Deindl von 2009 bis 2014 als Jane-Coffin-Childs-Postdoktorand und Stipendiat am Department of Chemistry and Chemical Biology an der Harvard University tätig, wo er in der Forschungsgruppe von Xiaowei Zhuang Einzelmolekül-Methoden entwickelte und auf die Untersuchung von Chromatin-Dynamik anwandte.

Im Jahr 2014 trat Deindl eine Assistenzprofessur an der Universität Uppsala an. Er wurde 2018 zum assoziierten Professor befördert und erhielt 2021 eine ordentliche Professur für Molekulare Biophysik. An der Universität Uppsala leitet er eine Forschungsgruppe im Bereich der mechanistischen Chromatinbiologie, die die komplexen molekularen Strukturen und Dynamiken von nukleinsäurebindenden Proteinen untersucht und ihre kollektive Rolle bei der Regulation der Genexpression, insbesondere im chromatinären Kontext. Im Jahr 2024 wurde er für eine Alexander von Humboldt-Professur ausgewählt. Bei Erfolg der Berufungsverhandlungen mit der Universität Freiburg wird er diese Stelle 2025 antreten.

Auszeichnungen

(Quelle: Alexander von Humboldt-Stiftung)

• 2017: ERC Starting Grant
• 2019: EMBO Young Investigator Award
• 2022: ERC Advanced Grant
• 2024: Alexander von Humboldt-Professur

Publikationen (Auswahl)

• mit L. Bacic, G. Gaullier, J. Mohapatra, G. Mao, K. Brackmann, M. Panfilov, G. Liszczak, A. Sabantsev: Asymmetric nucleosome PARylation at DNA breaks mediates directional nucleosome sliding by ALC1. In: Nature Communications, 15, 2024, S. 1000.
• mit E. Marklund, G. Mao, J. Yuan, S. Zikrin, E. Abdurakhmanov, J. Elf: Sequence specificity in DNA binding is mainly governed by association. In: Science, 375, 2022, S. 442–445.
• mit A. Sabantsev, G. Mao, J. Aguirre Rivera, M. Panfilov, A. Arseniev, O. Ho, M. Khodorkovskiy: Spatiotemporally controlled generation of NTPs for single-molecule studies. In: Nature Chemical Biology, 18, 2022, S. 1144–1151.
• mit G. Bowman: Sliding nucleosomes with a twist. In: Science, 366, 2019, S. 35–36.
• mit A. Sabantsev, R. Levendosky, G. Bowman: Direct observation of coordinated DNA movements on the nucleosome during chromatin remodelling. In: Nature Communications, 10, 2019, S. 1720.
• mit E. Marklund, B. van Oosten, M. Guanzhong, E. Amselem, K. Kipper, D. Globisch, X. Zheng, O. Berg, M. Johansson, J. Elf: DNA surface exploration and operator bypassing during target search. In: Nature, 583, 2020, S. 858–861.
• mit L. Lehmann, G. Hewitt, S. Aibara, A. Leitner, E. Marklund, S. Maslen, V. Maturi, Y. Chen, D. van der Spoel, J. Mark Skehel, A. Moustakas, S. Boulton: Mechanistic Insights into Autoinhibition of the Oncogenic Chromatin Remodeler ALC1. In: Molecular Cell, 68, 2017, S. 847–859.
• mit W. Hwang, B.T. Harada, X. Zhuang: Histone H4 tail mediates allosteric regulation of nucleosome remodelling by linker DNA. In: Nature, 512, 2014, S. 213–217.
• mit S.K. Hota, W.L. Hwang, T.R. Blosser, B. Bartholomew, X. Zhuang: ISWI remodelers slide nucleosomes with coordinated multi-base-pair entry steps and single-base-pair exit steps. In: Cell, 152, 2013, S. 442–452.
• mit Q. Yan, T. Barros, P.R. Visperas, T.A. Kadlecek, A. Weiss, J. Kuriyan: Structural basis for activation of ZAP-70 by phosphorylation of the SH2-kinase linker. In: Molecular and Cellular Biology, 33, 2013, S. 2188–2201.

Weblinks

• Sebastian Deindl bei Google Scholar
• Sebastian Deindl bei der Universität Uppsala