Yonathan Kapitolnik (hebräisch יונתן קפיטולניק, * 25. November 2002) ist ein israelischer Leichtathlet, der sich auf den Hochsprung spezialisiert hat.
Erste internationale Erfahrungen sammelte Yonathan Kapitolnik im Jahr 2019, als er beim Europäischen Olympischen Jugendfestival (EYOF) in Baku mit übersprungenen 2,00 m den achten Platz belegte. 2021 siegte er dann mit 2,25 m bei den U20-Europameisterschaften in Tallinn sowie anschließend mit 2,26 m auch bei den U20-Weltmeisterschaften in Nairobi. Im Jahr darauf belegte er bei den Balkan-Meisterschaften in Craiova mit 2,15 m den fünften Platz und anschließend gelangte er bei den Weltmeisterschaften in Eugene mit 2,24 m im Finale auf Rang elf. Im August verpasste er bei den Europameisterschaften in München mit 2,17 m den Finaleinzug. 2024 wurde er bei den Europameisterschaften in Rom mit 2,17 m Zwölfter.
In den Jahren von 2020 bis 2024 wurde Kapitolnik israelischer Meister im Hochsprung.