Wie im Vorjahr nahmen 32 Mannschaften an der Hauptrunde teil. An der Qualifikation nahmen 25 Mannschaften teil. Nach einem Ausscheidungsspiel wurden aus den verbliebenen 24 Mannschaften in drei Qualifikationsturnieren drei Teilnehmer für die Gruppenphase ermittelt.
In der Hauptrunde traten in acht Gruppen je vier Mannschaften pro Hauptrundengruppe in einem Rundenturnier gegeneinander an, in der jede Mannschaft je einmal ein Hin- und Rückspiel gegen jeden anderen Gruppenteilnehmer spielte. Die Ergebnisse ergaben pro Gruppe ein Ranking, in der die Gruppensieger sich direkt für die Achtelfinale qualifizierten, während die Zweit- und Drittplatzierten für eine Zwischenrunde im „Best-of-Three“-Modus qualifiziert waren. Die Gruppenletzten schieden aus dem Europapokal aus.
Die acht Gruppensieger sowie die acht Sieger aus der Zwischenrunde wurden in vier Gruppen je vier Mannschaften verteilt, wobei jede Mannschaft ein Hin- und Rückspiel gegen den anderen absolvierte. Die Mannschaften auf Plätzen 1 und 2 qualifizierten sich für die Viertelfinale, die verbliebene Vereine schieden aus.
In den Viertelfinalen wurden durch „Best-of-Three“-Modus vier Teilnehmer für das Final-Four-Turnier ermittelt, welches vom 26. bis 28. April 2023 stattfindet. Die Verlierer des einen Halbfinalspiels ermitteln im kleinen Finale den Drittplatzierten des Wettbewerbs, während die Sieger der Halbfinale in einem Finalspiel den Gesamtsieger ausspielen.
Die Qualifikation wurde in drei Qualifikationsturnieren mit einem einzelnen vorausgegangenen Ausscheidungsspiel durchgeführt. An jedem Qualifikationsturnier nahmen acht Mannschaften teil. Alle Spiele fanden im Zeitraum vom 24. September bis 1. Oktober 2023 statt. Austragungsorte der Qualifikationsspiele waren die Gloria Sports Arena in Belek und die Antalya Sports Hall in Antalya.
Die drei Gewinner der Qualifikationsturniere qualifizieren sich für die Gruppenphase. Von den in der Qualifikation ausgeschiedenen Mannschaften wechselten 18 in die Gruppenphase des FIBA Europe Cup 2023/24.
Die Gruppenphase mit je vier Mannschaften in acht Gruppen begann am 17. Oktober 2023 und endete am 20. Dezember 2023.
Die Gruppensieger qualifizierten sich direkt für das Achtelfinale, die Gruppenzweiten und -dritten für die Zwischenrunde.
Die Zwischenrunde wurde im „Best-of-Three“-Modus gespielt. Die Sieger der Zwischenrunde qualifizierten sich für das Achtelfinale, welches als eine weitere Gruppenphase ausgetragen wurde. Die ersten Spiele der Zwischenrunde fanden am 2. und 3. Januar 2024 statt, die zweiten Spiele am 10. und 11. Januar 2024. Die bei Gleichstand zusätzlichen dritten Spiele wurden am 16. und 17. Januar 2024 gespielt.
Die Spiele der Achtelfinale fanden zwischen dem 23. Januar 2024 und dem 20. März 2024 statt. Die jeweils Erst- und Zweitplatzierten einer Gruppe sind für das Viertelfinale qualifiziert. Für die Gruppenplatzierungen sind bei Mannschaften mit gleicher Anzahl von Siegen nicht das gesamte Korbpunktverhältnis, sondern nur das addierte Ergebnis im direkten Vergleich der Mannschaften untereinander entscheidend.
Das Viertelfinale wird im „Best-of-Three“-Modus gespielt. Die Sieger der Viertelfinale qualifizieren sich für das Final-Four-Turnier. Die ersten Spiele des Viertelfinales fanden am 3. April 2024 statt, die zweiten Spiele am 9. und 10. April 2024. Die bei Gleichstand zusätzlichen dritten Spiele wurden am 16. und 17. April 2024 gespielt.
Unicaja Málaga
Caledonia Gladiators
Bakken Bears
KB Peja
Norrköping Dolphins
BC Kalev
Benfica Lissabon
TSU Tbilisi
AEK Larnaka
BK Patrioti Levice
Cholet Basket
Antwerp Giants
Pallacanestro Varese
KK FMP
CSM Oradea
Heroes Den Bosch
BG Göttingen
CBet Jonava
Ironi Ness Ziona
Kauhajoen Karhu
Legia Warsaw
KK Mornar Bar
GS Peristeri
Falco KC Szombathely
BK Opava
Darüşşafaka
BK VEF Rīga
Igokea Aleksandrovac