Benutzer Diskussion:SCIdude
Herzlich willkommen in der Wikipedia, SCIdude!
[Quelltext bearbeiten]Ich habe gesehen, dass du dich vor kurzem hier angemeldet hast und möchte dir daher für den Anfang ein paar Tipps geben, damit du dich in der Wikipedia möglichst schnell zurechtfindest.
Schritt-für-Schritt-Anleitung für Artikelschreiber | Wie man gute Artikel schreibt | Wenn du Fragen hast |
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- Bitte gib bei Artikelbearbeitungen möglichst immer Belege an (am besten als Einzelnachweis) und begründe deine Bearbeitung kurz in der Zusammenfassungszeile. Damit verbesserst du die Nachvollziehbarkeit von Informationen.
- Nicht alle Themen und Texte sind für eine Enzyklopädie wie die Wikipedia geeignet. Daher kannst du Enttäuschungen beim Schreiben und Bearbeiten von Artikeln vermeiden, wenn du dir zuvor Wikipedia:Was Wikipedia nicht ist anschaust.
- Um in Diskussionen leicht zu erkennen, wer welchen Beitrag geschrieben hat, ist es üblich, seine Beiträge mit
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zu signieren. Das geht am einfachsten mit dem Knopf in deinem Bearbeitungsfenster. - Hilfe:Übersicht zeigt dir den Zugang zu allen Hilfethemen.
- Hilfe:Glossar informiert dich, wenn du Abkürzungen oder Ausdrücke in den Editkommentaren oder auf Diskussionsseiten nicht verstehst.
- Ansprechpartner für medizinische Artikel findest du in der Redaktion Medizin. Wir freuen uns immer über Interessenten und neue Mitarbeiter!
- Falls du an einem persönlichen Ansprechpartner für deine ersten Schritte bei Wikipedia interessiert bist, so findest du einen Betreuer im Mentorenprogramm.
Schön, dass du zu uns gestoßen bist!
Einen guten Start wünscht dir Polarlys (Diskussion) 21:25, 22. Mai 2013 (CEST).
PMID-zu-Wikipedia-Reference-Konverter
[Quelltext bearbeiten]Hallo! Für die Arbeit mit Belegen, die in PubMed gelistet sind oder einen Digital Object Identifier (DOI) haben, kann ich dir das Werkzeug PMID-zu-Wikipedia-Referenz-Konverter sehr empfehlen. Egal ob die PubMed-ID (PMID) bekannt ist, die DOI-Angabe oder man nur den Titel der Arbeit kennt: Das Tool erzeugt aus diesen Angaben und ohne eigene Tipparbeit eine Literaturangabe, die man nur noch an die richtige Stelle des Wikipedia-Textes setzen muss. Viele Grüße, --Polarlys (Diskussion) 21:25, 22. Mai 2013 (CEST)
Ranitidin
[Quelltext bearbeiten]Hallo SCIdude, Du hast ja auf WD vor einiger Zeit mal in (E)-N-{2-[({5-[(dimethylamino)methyl]-2-furanyl}methyl)thio]ethyl}-N′-methyl-2-nitro-1,1-ethenediamine hydrochloride (Q72506152) aufgeräumt und viele Statements nach (Z)-N-{2-[({5-[(dimethylamino)methyl]-2-furanyl}methyl)thio]ethyl}-N′-methyl-2-nitro-1,1-ethenediamine hydrochloride (Q27108147) verschoben. Im Objekt zum E-Isomer stehen aber nach wie vor zwei CAS-Nummern (71130-06-8 und 66357-59-3), wobei ich bei keinem der zugehörigen Einträge in Common Chemistry eine Zuordnung hinsichtlich der Isomere erkennen könnte, sondern lediglich, dass es sich um Hydrochloride unterschiedlicher Stöchiometrie handelt. Kannst Du da nochmal schauen? --Mabschaaf 08:29, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Das ist richtig, beide CAS legen sich nicht fest. In der Realität scheint Ranitidin eine E/Z-Mischung zu sein, da schnelle Isomerisierung stattfindet, was der Grund für die CAS-Einträge sein könnte. Protoniertes Ranitidin scheint dagegen haptsächlich in Z-Konfiguration vorzuliegen. So hört es sich jedenfalls bei DOI:10.1039/b801591k an, deren Ref. 11-15 wohl die Details dazu haben. Komme gerade nicht dazu, weiterzulesen. --SCIdude (Diskussion) 09:09, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Wäre schön, wenn Du das noch klärst, vor allem wäre ich gerne die CAS-Dopplung auf WD los, sei es, indem eine davon gelöscht oder ein neues Item dafür angelegt wird.--Mabschaaf 09:26, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Meine Haupttätigkeiten momentan sind COVID-19 Biocuration für Reactome und die Einrichtung einer Stoff-Ontologie für Chemie-Wikidata. CAS-Dopplungen sind eher unter "ferner liefen" für mich. Kann also noch dauern. --SCIdude (Diskussion) 09:34, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Vielleicht hat Benutzer:Benff Zeit dafür?--Mabschaaf 10:54, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Meine Haupttätigkeiten momentan sind COVID-19 Biocuration für Reactome und die Einrichtung einer Stoff-Ontologie für Chemie-Wikidata. CAS-Dopplungen sind eher unter "ferner liefen" für mich. Kann also noch dauern. --SCIdude (Diskussion) 09:34, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Wäre schön, wenn Du das noch klärst, vor allem wäre ich gerne die CAS-Dopplung auf WD los, sei es, indem eine davon gelöscht oder ein neues Item dafür angelegt wird.--Mabschaaf 09:26, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Hallo Benutzer:Mabschaaf, was mich irritiert ist, dass es offenbar nur WP-Objekte zu je (Z)-Ranitidin-HCl und (E)-Ranitidin-HCl gibt, hingegen keines für Ranitidin-HCl, oder übersehe ich etwas? Letzteres ist die arzneilich verwendete Substanz, ihr ist laut Ph Eur die CAS -Nr. 66357-59-3 zugeordnet, was sich mit den Daten in CAS Common Chemistry deckt, ebenso mit dem SRS der FDA. Der Arzneimittelstoffkatalog gibt beide CAS-Nummern an. Die WHO-Liste 19 ist von 1979 und gibt noch keine Nummer an. In keinem der Register/Kataloge gibt es einen Hinweis auf eine Z- oder E-Konfiguration, auch im Arzneibuch nicht. Gemäß den Angaben in CAS Common Chemistry verstehe auch ich den Unterschied zwischen 66357-59-3 und 71130-06-8 als einen im stöchiometrischen Verhältnis von Base und Hydrochlorid. Mein Vorschlag wäre: neues WD-Item Ranitidine hydrochloride anlegen mit der CAS-Nr 66357-59-3. (E)- und (Z)-Ranitidine hydrochloride umbenennen in (E)- und (Z)-N-{2-[({5-[(dimethylamino)methyl]-2-furanyl}methyl)thio]ethyl}-N′-methyl-2-nitro-1,1-ethenediamine hydrochloride. Ob man da dann was mit Exakt- und Untermengen-Zuordnung und SKOS-Qualifier angeben kann in der Art wie hier beschrieben, weiß ich nicht, ich habe das nicht verstanden. --Benff 21:36, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Welchen Beleg gibt es denn dass das produzierte Medikament eine E/Z Mischung ist? Bei älteren Stoffen weiss man das oft gar nicht. Aber der Vorschlag ist gut, ein neues Item zu erstellen ist nicht schwer, und mit move.js kann man locker Statements und Links hin- und herschieben, probiert es doch mal aus. Dann sind aber noch die zwei CAS, und welche nun bevorzugt werden soll, ist ja immer noch nicht klar. --SCIdude (Diskussion) 06:34, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Ich habe nun Ranitidinhydrochlorid (Q107412401) neu erstellt und einige Statements verschoben - hoffentlich habe ich alle richtig erwischt.--Mabschaaf 13:52, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Der CHEBI und der PubChem ist aber die (E)-Verbindung. Du darfst nicht nach den Namen gehen, nur der InChi bzw Key ist ausschlaggebend. Ein häufiger Fehler. Das (E/Z) ist auch keine Verbindung, sondern eine Mischung. Ich mach das mal. --SCIdude (Diskussion) 15:46, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Man könnte diesen PubChem-Eintrag nehmen: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/47909 hier ist die Konformation der Doppelbindung nicht festgelegt. Ich weiß aber nicht, ob es gut ist, wenn man nicht mal weiß ob die Mischung 1:1 E:Z ist. Aber ganz falsch wäre es nicht. --SCIdude (Diskussion) 15:59, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Ich habe nun Ranitidinhydrochlorid (Q107412401) neu erstellt und einige Statements verschoben - hoffentlich habe ich alle richtig erwischt.--Mabschaaf 13:52, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Welchen Beleg gibt es denn dass das produzierte Medikament eine E/Z Mischung ist? Bei älteren Stoffen weiss man das oft gar nicht. Aber der Vorschlag ist gut, ein neues Item zu erstellen ist nicht schwer, und mit move.js kann man locker Statements und Links hin- und herschieben, probiert es doch mal aus. Dann sind aber noch die zwei CAS, und welche nun bevorzugt werden soll, ist ja immer noch nicht klar. --SCIdude (Diskussion) 06:34, 4. Jul. 2021 (CEST)
- Hallo Benutzer:Mabschaaf, was mich irritiert ist, dass es offenbar nur WP-Objekte zu je (Z)-Ranitidin-HCl und (E)-Ranitidin-HCl gibt, hingegen keines für Ranitidin-HCl, oder übersehe ich etwas? Letzteres ist die arzneilich verwendete Substanz, ihr ist laut Ph Eur die CAS -Nr. 66357-59-3 zugeordnet, was sich mit den Daten in CAS Common Chemistry deckt, ebenso mit dem SRS der FDA. Der Arzneimittelstoffkatalog gibt beide CAS-Nummern an. Die WHO-Liste 19 ist von 1979 und gibt noch keine Nummer an. In keinem der Register/Kataloge gibt es einen Hinweis auf eine Z- oder E-Konfiguration, auch im Arzneibuch nicht. Gemäß den Angaben in CAS Common Chemistry verstehe auch ich den Unterschied zwischen 66357-59-3 und 71130-06-8 als einen im stöchiometrischen Verhältnis von Base und Hydrochlorid. Mein Vorschlag wäre: neues WD-Item Ranitidine hydrochloride anlegen mit der CAS-Nr 66357-59-3. (E)- und (Z)-Ranitidine hydrochloride umbenennen in (E)- und (Z)-N-{2-[({5-[(dimethylamino)methyl]-2-furanyl}methyl)thio]ethyl}-N′-methyl-2-nitro-1,1-ethenediamine hydrochloride. Ob man da dann was mit Exakt- und Untermengen-Zuordnung und SKOS-Qualifier angeben kann in der Art wie hier beschrieben, weiß ich nicht, ich habe das nicht verstanden. --Benff 21:36, 3. Jul. 2021 (CEST)
- Bei der Substanz mag es sich um Ranitidinmonohydrochlorid handeln, sie heißt aber nicht so, sondern schlicht „Ranitidinhydrochlorid“ (englisch: ranitidine hydrochloride). Deswegen wäre das Label (in Übereinstimmung mit dem Namen in Registern/Datenbanken) noch abzuändern, zB indem man die Angabe mit dem unter „known as“ tauscht. E/Z im Label finde ich auch nicht okay. Es gibt kein (E/Z)-Ranitidinhydrochlorid, sondern es gibt (E)-N-[2-({5-[(Dimethylamino)methyl]furan-2-yl}methylsulfanyl)ethyl]-N'-methyl-2-nitroethen-1,1-diaminhydrochlorid und (Z)-N-[2-({5-[(Dimethylamino)methyl]furan-2-yl}methylsulfanyl)ethyl]-N'-methyl-2-nitroethen-1,1-diaminhydrochlorid und Ranitidinhydrochlorid darf das eine oder das andere sein oder eine Mischung aus beiden. Und nicht zu vergessen, dass noch tautomere Formen existieren. --Benff 23:07, 5. Jul. 2021 (CEST)