Haloferax

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Haloferax

Haloferax volcanii
(Phasenkontrastmikroskop-Aufnahme)

Systematik
Domäne: Archaeen (Archaea)
Abteilung: Euryarchaeota
Klasse: Halobacteria
Ordnung: Haloferacales
Familie: Haloferacaceae
Gattung: Haloferax
Wissenschaftlicher Name
Haloferax
Torreblanca et al. 1986

Haloferax ist eine Gattung der Familie Haloferacaceae (LPSN[1] und NCBI[2]); früher wurde die Gattung in die Familie Halobacteriaceae gestellt.[3]

Nach einer umfassenden Studie über extrem halophile Halobacteria wurden 1986 zwei der untersuchten Stämme als neue Arten charakterisiert, Haloarcula hispanica (Stamm Y27 alias ATCC 33960) und Haloferax gibbonsii (Stamm MA2.38 alias ATCC 33959).[4]

Das Genom von Haloferax massiliense wurde 2018 sequenziert.[5]

Genetischer Austausch

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Zellen von Haloferax mediterranei und Zellen der verwandten Spezies Haloferax volcanii[6] können einen genetischen Austausch zwischen zwei Zellen durchlaufen (horizontaler Gentransfer, HGT).[7]

Obwohl ein solcher genetischer Austausch normalerweise zwischen zwei Zellen derselben Spezies stattfindet, kann er auch mit niedrigerer Frequenz zwischen einer H. mediterranei- und einer H. volcanii-Zelle auftreten. Die beiden Spezies haben eine durchschnittliche Nucleotidsequenz-Übereinstimmung von 86,6 %.[7] Während dieses Austauschprozesses fusionieren zwei Zellen zu einer heterodiploiden Zelle, welche die beiden verschiedenen Chromosomen und somit das gesamte genetische Repertoire der beiden parentalen Zellen enthält. Dadurch wird die genetische Rekombination gefördert. Anschließend trennen sich die Zellen, wobei rekombinante Zellen entstehen können.

Siehe auch

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Weiterführende Literatur

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  • A. Oren, A. Ventosa: International Committee on Systematic Bacteriology Subcommittee on the taxonomy of Halobacteriaceae. Minutes of the meetings, 16 August 1999, Sydney, Australia. In: International journal of systematic and evolutionary microbiology. Band 50, Nr. 3, Mai 2000, S. 1405–1407; doi:10.1099/00207713-50-3-1405, PMID 10843089 (englisch).
  • Marina Torreblanca, F. Rodriguez-Valera, Guadalupe Juez, Antonio Ventosa, Masahiro Kamekura, Morris Kates: Classification of Non-alkaliphilic Halobacteria Based on Numerical Taxonomy and Polar Lipid Composition, and Description of Haloarcula gen. nov. and Haloferax gen. nov. In: Systematic and Applied Microbiology. Band 8, Nr. 1–2, Juli 1986, S. 89; doi:10.1016/s0723-2020(86)80155-2 (englisch).
  • Joshua Mills, L. Johanna Gebhard, Florence Schubotz, Anna Shevchenko, Daan R. Speth, Yan Liao, Iain G. Duggin, Anita Marchfelder, Susanne Erdmann: Extracellular vesicle formation in Euryarchaeota is driven by a small GTPase. In: PNAS, Band 121, Nr. 10, 26. Februar 2024, e2311321121; doi:10.1073/pnas.2311321121 (englisch). Dazu:

Viren

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Ein Beispiel für ein Haloferax parasitierendes Virus ist HFTV1 (Spezies Retbasiphovirus HFTV1, früher Haloferax tailed virus 29) aus der Familie Haloferuviridae (Ordnung Kirjokansivirales der Klasse Caudoviricetes, Morphotyp Siphoviren).[8][9]

Ein weiteres Beispiel ist die Spezies Haloferacalesvirus HF1 alias Haloferax-Virus HF1 aus der Familie Hafunaviridae (Ordnung Thumleimavirales der Klasse Caudoviricetes, Morphotyp Myoviren).[10][9]

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Commons: Haloferax – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

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Einzelnachweise

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  1. ↑ Liste prokaryotischer Namen LPSN, List of prokaryotic names with standing in nomenclature
  2. ↑ Taxonomy browser des NCBI, ID 2251, National Center for Biotechnology Information
  3. ↑ Radhey S. Gupta, Sohail Naushad, Sheridan Baker: Phylogenomic analyses and molecular signatures for the class Halobacteria and its two major clades: a proposal for division of the class Halobacteria into an emended order Halobacteriales and two new orders, Haloferacales ord. nov. and Natrialbales ord. nov., containing the novel families Haloferacaceae fam. nov. and Natrialbaceae fam. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 65, Pt 3, März 2015, ISSN 1466-5034, S. 1050–1069, doi:10.1099/ijs.0.070136-0, PMID 25428416.
  4. ↑ Guadalupe Juez, F. Rodriguez-Valera, Antonio Ventosa, Donn J. Kushner: Haloarcula hispanica spec. nov. and Haloferax gibbonsii spec. nov., two new species of extremely halophilic archaebacteria. In: Syst. Appl. Microbiol., Band 8, 1986, S. 75–79.
  5. ↑ Saber Khelaifia, Aurelia Caputo, Claudia Andrieu, Frederique Cadoret, Nicholas Armstrong, Caroline Michelle, Jean-Christophe Lagier, Félix Djossou, Pierre-Edouard Fournier, Didier Raoult: Genome sequence and description of Haloferax massiliense sp nov., a new halophilic archaeon isolated from the human gut. In: Extremophiles, Springer Verlag, Band 22, Nr. 3, 2018, S. 485–498, doi:10.1007/s00792-018-1011-1, hal-01780673
  6. ↑ Bernhard Tschitschko et al.: Genomic variation and biogeography of Antarctic haloarchaea, in: Microbiome, Band 6, Nr. 113, 2018; doi:10.1186/s40168-018-0495-3.
    Ricardo Cavicchioli: Behind the paper: Antarctic haloarchaea – a unique Microbiome, in: Microbiology, 19. Juni 2018.
  7. ↑ a b A. Naor, P. Lapierre, M. Mevarech, R. T. Papke, U. Gophna: Low species barriers in halophilic archaea and the formation of recombinant hybrids. In: Current biology : CB. Band 22, Nummer 15, August 2012, S. 1444–1448, doi:10.1016/j.cub.2012.05.056, PMID 22748314.
  8. ↑ Y. Liu, Mart Krupovic et al.: ICTV Proposal 2021.001A (zip:docx), PDF (via Universität Helsinki). Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020.
  9. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  10. ↑ ICTV: Taxonomy History: Haloferacalesvirus HF1
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