Die Rugby-Union-Afrikameisterschaft 2008/09 (englisch2008–09 Rugby Africa Cup, französischCoupe d’Afrique de rugby à XV 2008/09) der Division 1 war die neunte Ausgabe der afrikanischen Kontinentalmeisterschaft in der Sportart Rugby Union. Es waren 14 Teams beteiligt, die zunächst auf 12 reduziert wurden und anschließend in vier Dreiergruppen eingeteilt waren. Jedes dieser Teams bestritt ein Heim- und Auswärtsspiel gegen die anderen Teams der Gruppe. Die Gruppensieger zogen ins Halbfinale ein, die Halbfinalsieger ermittelten den Afrikameister. Den Afrikameistertitel gewann zum dritten Mal Namibia.
Swasiland, Nigeria und Botswana wurden zusätzlich in die WM-Qualifikation aufgenommen, da sie in der IRB-Weltrangliste platziert waren. Vor dem Beginn des eigentlichen Turniers traten die beiden niedrigsten eingestuften Mannschaften aus dem Süden (Botswana und Swasiland) sowie aus dem Norden (Kamerun und Nigeria) in einer Vorqualifikation gegeneinander an. Auf diese Weise wurde die Teilnehmerzahl von 14 auf 12 reduziert, um vier Dreiergruppen bilden zu können.
Für einen Sieg gab es vier Punkte, für ein Unentschieden zwei Punkte, bei einer Niederlage null Punkte. Je einen Bonuspunkt gab es für das Erzielen von vier Versuchen oder bei einer Niederlage mit sieben oder weniger Spielpunkten Unterschied.